O Laboratório de Saneamento ocupa uma área de 250 m² com setores destinados às análises física, química e microbiológica de resíduos sólidos, águas residuárias, águas para abastecimento. A unidade de tratamento de águas e resíduos – LabTAR agregou ao laboratório uma área de 122 m2. Também em área anexa, há um galpão de 120,00 m2 construído com recursos FINEP/PETROBRAS que abriga um sistema piloto de gaseificação e produção de energia elétrica. O gaseificador piloto tem 8,0 m de altura e alimenta um grupo gerador adaptado para funcionar com gás de síntese, com capacidade para 30 kvA de energia. Também em função dos projetos de fomento, foi viabilizada na Fazenda Escola da UEL, uma obra composta por Área de recepção de resíduos do restaurante universitário – RRU, da granja suína – RGS e de poda vegetal – RPV produzidos no Campus, Sistema de biodigestão destes resíduos com capacidade volumétrica de 40 m3, Sistema de armazenamento e tratamento do biogás gerado, além do abrigo do Grupo gerador de energia elétrica a ser conectado à rede da UEL. Os projetos conjuntos com os Programas de Pós-Graduação do Centro de Ciência de Alimentos CCA em Ciência de Alimentos e Agronomia, do Centro de Ciências Exatas – CCE em Biotecnologia e Química, e do Centro de Ciências Biológicas – CCB em Patologia Experimental possibilitaram a construção de um Laboratório multidisciplinar denominado CENTRO DE TREINAMENTO E PESQUISA EM SEGURANÇA DE ALIMENTOS E ÁGUA, em janeiro de 2012 pela UGF SETI, Fundo Paraná. Neste laboratório, provido de linha estabilizada e gerador de energia, foram alocados equipamentos de química instrumental sensíveis já adquiridos e disponibilizados para pesquisas do grupo: LC-MS/MS (Quattro micro API quadrupole mass spectrometer da Waters), Termociclador para PCR em tempo real (LightCycler 96 da Roche), Cuba completa p/ eletroforese bidimensional, 02 Centrífugas refrigeradas (5804R e 5810R da Eppendorf), Leitora ELISA (Expert Plus da Asys), HPLC-PDA (Shimadzu), Freezer (-85°C) (CFC free da Sanyo), Estufa CO² (3110 da Forma Scientific), Espectrofotrômetro de fluorênscencia (Cary Eclipse da VARIAN), Ultra sonicador (Ultracleaner 800 da UNIQUE), Microscópio Invertido Trinocular (Nikon), 02 Balanças Analíticas (Mod.MS204S e Mod.XS205DU da Mettler Toledo), Leitora espectrofotométrica (Zenyth 200 RT da Biochrom/Anthos), entre outros. Fisicamente próximo ao laboratório de saneamento, foi finalizada a construção, em 2011, do Laboratório de Reciclagem de Resíduos – RECICLA, com 200,00 m2 de área construída. Este laboratório foi construído com recursos FINEP (Proinfra, MCT/FINEP Ação Transversal Proinfra 01/2007) e tem como objetivo ser um laboratório multiusuário e abrigar pesquisas nas várias áreas do conhecimento voltadas para a reciclagem de resíduos urbanos. Os resíduos objeto desta pesquisa são as pilhas e baterias (Departamento de Física), lâmpadas (Departamento de Química) e lixiviados de aterros e resíduos de construção civil (Departamento de Construção Civil). Com o apoio da Prefeitura do Campus, foi designado um grupo técnico para implantar um sistema de coleta de resíduos de todos os laboratórios da UEL. Esses resíduos são separados, etiquetados e armazenados por grupos de classificação. Há ainda, outros laboratórios usados para graduação e com menos envolvimento nas atividades do curso, como o laboratório de Sistemas Hidráulicos Prediais, que ocupa uma área de 150 m2. Este laboratório tem infraestrutura de reservatórios, bombas, bancadas e ferramentas de testes para equipamentos hidráulicos. No mesmo prédio funciona o laboratório de Hidráulica e Fenômenos de Transporte com equipamentos para medição de viscosidade, perdas de carga, realização de experimentos com diferentes regimes de escoamento e um canal de 8,0 m de comprimento que permite a variação da declividade para ensaios de escoamento em condutos livres, além de vertedores triangular e retangular de parede delgada e retangular de parede espessa. Estes equipamentos são usados no Curso de Graduação em Engenharia Civil.